Aula 04 - Microbiologia do Solo, Rizosfera e Endofíticos - Profa. Isabella Dal'Rio

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Caio Rachid
Nessa aula a Isabela Dal'Rio, doutoranda em Microbiologia irá falar sobre as principais característi...
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e fala galera muito bom dia meu nome é Isabela del rio Sou formada em microbiologia e imunologia pelas RJ fiz meu mestrado em biotecnologia vegetal e atualmente estou fazendo doutorado também biotech vegetal e hoje eu vou conversar um pouco com vocês sobre microbiologia do solo da região esfera e da região em do física de plantas e é comuns quando a gente pensa na microbiota do solo a gente tem que pensar em uma característica específica que descreva como essa microbiota e eu acho que o que a gente pode atribuir essa microbiota que ela é extremamente variável
isso porque a microbiota do solo dependendo da região e que nós estamos avaliando ela vai sofrer influência de muitos fatores esses fatores vão causar diretamente impactos nessa microbiota local então eu trouxe essa imagem para a gente entender melhor Como funciona essa compartimentalização então aqui eu vou citar alguns exemplos que podem modular essa microbiota bom então a gente tem por exemplo a região riso esférica ou a rizosfera avisou espera é a região do solo que está próximo das raízes das plantas e vai sofrer influência dos produtos que são liberados por essas raízes Ok então nessa região
é esses estudados vão modular a microbiota local ali presente sol e a gente também consegue observar diferença e se a gente tá falando da região espera de uma planta de uma floresta ou se a gente tá falando da rizosfera de uma planta em um sistema de monocultura isso por conta do manejo do solo e das condições físico-químicas e outros fatores que a gente vai discutir melhor mais à frente é uma outra zona por exemplo zona fótica a zonas forte que a região mais superficial do solo é uma região onde vai ter incidência solar o dia
inteiro radiação ver também vai pegar ali diretamente então esses microrganismos também vão precisar possuir mecanismos para sobreviver a essas condições tava também vai ser diferente que você gente compara com uma região rizosférico tem um pouco mais profunda é uma outra região é abri-los fera hidrosfera é a região do solo que fica em contato com microrganismos eucarióticos e essa região vai sofrer influência dos produtos metabólicos desses organismos eucarióticos esse micro esses organismos eucarióticos nada mais são que as minhocas e a metabolismo das minhocas vai fazer com que elas liberam produtos na região do solo que vai
modular essa microbiota também com a proximidade da microbiota corpos d'água também é um Outro fator que vai influenciar ó E além disso para vocês terem uma noção do quanto isso pode ser diferente mas temos microambientes de fato sendo formados dentro de agregados de solos então que a gente vai observar aqui na superfície dos agregados do solo nós vamos ter uma condição de temos maior disponibilidade de oxigênio onde temos maior disponibilidade de água que é diferente do que ocorre no interior desses agregados do solo e nesses dois locais diferentes a gente vai observar uma microbiota diferente
e isso é interessante porque a distância de um ponto para o outro pode ser de centímetros ou milímetros E além disso também diferentes horizontes vão possuir uma microbiota diferenciada então se você tava olhando um Sol do Horizonte ou ele vai ser diferente quando comparado com aqui é diferente do beijo diferente do ser tão Isso é só para a gente ter uma noção de que a posição o local onde a gente tava olhando a sua microbiota vai influenciar aliado ainda outros fatores isso porque esses fatores eles também podem ser interdependentes então eu posso estar avaliando uma
comunidade bacteriana da rizosfera do Horizonte or e um sistema de monocultura com a presença de uma de Los fera então por que é importante a gente saber todos estes fatores né Se vocês pensam em trabalhar como entra biologia dos solos é importante que a gente tem a noção que esses fatores são relevantes para quando a gente vai fazer uma coleta por exemplo é importante a gente saber como são as condições do ambiente que a gente já pode se preparar porque que a gente E vai encontrar nesse ambiente e aqui para exemplifi car um pouco mais
essa é uma parte que a gente vai se aprofundar na aula de hoje que é da região riso esférica Então o que tem aqui nessa imagem nesse só colocar uma ponteira aqui o que tem aqui nessa imagem é uma plantinha com as raízes dela aqui o book sol e o seria o solo não esférico então é um solo que não está sofrendo influência das raízes e da planta e aqui seria o solo rizosférico que sofrem influência das raízes da planta então a gente já consegue ver aqui que são regiões que são próximas mas a gente
vai encontrar uma microbiota específica na região visou esférica que vai ser diferente da microbiota do solo não rizosférico bom então vamos falar um pouco mais sobre a microbiologia do solo Então como é que é essa microbiota né como mencionei com vocês a o solo vai compor diversos ambientes com diferentes características microbianas esses diferentes ambientes nós chamamos eles de micro-habitats e eles vão possuir condições altamente variáveis de um ponto para o outro logo a microbiota desse locais também será altamente variável a maioria desse micro-organismos que estão presentes no solo ele ainda são desconhecidos e Porque durante
muito tempo nós trabalhamos com técnicas de cultivo e as técnicas de cultivo só permite que a gente recupera uma parte de toda diversidade microbiana que pode estar presente ele atualmente nós temos as técnicas de sequenciamento que tem permitido que a gente conhece um pouco melhor sua microbiota sem necessariamente precisar isolar esses microorganismos bom e o que a gente sabe sobre eles é que eles são essenciais para os ciclos biogeoquímicos é aqui nesse canto aqui da esquerda a gente consegue ver uma quantificação de grupos de microrganismos na biomassa microbiana presente no solo a biomassa microbiana é
a parte do solo que vai possuir esses microrganismos muito importantes para ciclagem de nutrientes e o que a gente observa aqui é que a gente consegue recuperar esses locais uma quantidade muito maior de bactérias e fungos quando comparado com a quantidade de artes e quando comparado a quantidade de protistas e de vírus então Se vocês fizerem uma rápida busca no Google Acadêmico por exemplo vocês vão encontrar muitos trabalhos voltados para a comunidade bacteriana e fúngica do solo bom então esses outros de microrganismos ainda não são tão explorados conto a as bactérias e os Fundos bom
então falando um pouco sobre os fatores bióticos e abióticos que podem afetar a microbiota do solo eu trouxe essa imagem que mostra para a gente os fatores que são considerados menos importantes para os mais importantes eu queria ressaltar aqui que essa essa coisa de menos mais importante na verdade é o quão fácil é para gente fazer essa correlação então pra gente fazer uma correlação de variação do pH do solo e variação da microbiota é muito mais fácil do que fazer por exemplo uma correlação em relação à predação que aí já é muito mais complexo só
para vocês entenderem que pode ser no caso uma farda da própria pesquisa que a gente não consiga dar tanta relevância para esses outros fatores aqui é mas enfim os fatores bióticos vão ser fatores como PH a temperatura e concentração de oxigênio e os fatores bióticos já falam em relação às interações microbianas EA genética desses microrganismos então nós temos aqui como fatores mais importantes o pH do solo quantidade e qualidade de carbono orgânico concentração de oxigênio estado redox do solo o estado redox está associado a qual fácil é a troca de nutrientes entre os microrganismos a
planta e esse solo Tá além disso nós também temos fatores como umidade do solo disponibilidade de água disponibilidade de outros nutrientes como fósforo e nitrogênio a textura e estrutura do solo a temperatura e por último espécies de plantas e predação bom então vamos falar um pouco sobre a variação de PH e como isso pode afetar microbiota do solo para vocês terem uma noção melhor de como isso vai funcionar então aqui nessa imagem que a gente observa é a diversidade filogenética de espécies aqui no eixo Y e no eixo X a gente vai ter a variação
do PH no solo Ok então aqui foi feito uma quantificação desses de microrganismos e o que foi possível observar que quanto menores PH quanto mais próximo então de três e quatro menor essa diversidade microbiana e o mesmo acontece quando a gente fala de PH esqueçam muito altos então quanto mais próximos de 8 9 a gente vai ter uma diversidade microbiana menor bom e quando a gente tá aqui no PH próximo de 66 e meio é o ponto onde a gente observa uma maior diversidade microbiana tão só por isso aqui a gente já consegue avaliar como
o PH vai alterar essa comunidade microbiana Lembrando que isso aqui vai afetar diretamente nos ciclos biogeoquímicos por exemplo como a gente vai ver um pouco mais à frente é aqui ao lado que foi avaliado foi o número de fenótipos a gente pode fazer uma conexão com o número de espécies estão aqui no caso o que o autor estava tentando ver a riqueza em relação ao número de espécies local então a gente vê que quando a gente tem um pH baixo e alto a gente tem o mesmo padrão que a gente viu anteriormente Vai ser menor
o número de espécies e quando a gente tem aqui Um PH próximo de 6 a gente já tem o maior número de espécies tão Provavelmente quando a gente fala de ciclagem de nutrientes por exemplo o ideal seria que a gente tivesse um solo com ph mais próximo de seis hoje a gente tem uma maior diversidade microbiana e o maior número de espécies podendo tornar assim Ah os ciclos biogeoquímicos nessa ciclagem de nutrientes mais eficiente e em seguida o que se autor fez foi quantificar alguns filos e classes de microrganismos aqui no caso de bactérias e
avaliar como esses microrganismos variavam em relação a abundância relativa AC no Egito psilon e no eixo X a gente vê o pH do solo então olhando aqui actinobactéria e bacteroidetes a gente tem um padrão muito similar quando a gente tem um PH muito baixo aqui próximo de quatro a gente tem uma abundância relativa de bacteroidetes de actinobactéria baixa quando a gente vê um PH mais alto a gente já tem uma abundância relativa mais alta e aqui no meio a gente tem uma concentração assim uma quantidade intermediária desses grupos é o contrário vai acontecer para o
fio ácido bactéria que a gente vê que um pega muito bate tem uma maior abundância relativa e um PH muito alto e uma menor abundância e quando a gente fala das da Classe A Alpha proteobacteria a gente já viu uma distribuição mas é e mais estável ao longo do tempo certo a gente vai observar grupos tanto num PH mais baixo quanto não pega mais alta já as classes Beta e Gama proteobactérias que a gente observa é quem pega altos e baixos essa abundância vai ser baixa e não ph6 é onde a gente consegue uma abundância
relativa mais alta dessas classes Então essas classes possuem vários Takes vários gêneros diferentes certo mais incluem bactérias que são muito importantes para ciclagem de nutrientes no solo Principalmente quando a gente fala do filo actinobacteria tá bom Tá bom então quando a gente pensa em um ambiente por exemplo aqui no Rio de Janeiro na aqui no Rio de Janeiro de manhã a gente tem uma temperatura mais amena quando chega mais ou menos meio-dia às vezes chega a 40 graus e à noite a temperatura pode cair até uns 20 graus geralmente mais quente do que isso né
mas essas alterações essas flutuações de temperatura ao longo do dia leva uma pequenas adaptações da microbiota do solo mas a microbiota tende a ficar de uma forma estável Então essa variação de temperatura causa um impacto nessa microbiota mas ela tende a voltar ao equilíbrio acontece que às vezes esses fatores eles podem se tornar fatores de estresse isso é quando a gente tem por exemplo um PH muito alto durante um longo período de tempo se pode fazer com que ocorra uma desestabilização dessa microbiota e fazer com que ela não consiga mais retornar Oi para o equilíbrio
dela anteriormente isso impacta diretamente nos ciclos de nutrientes então falando sobre esses fatores de estresse são fatores que vão desafiar o crescimento EA sobrevivência destes microorganismos do solo e você tá alguns exemplos pra gente entender um pouco melhor eu vou mudar minha câmera aqui também porque eu acho que vou ficar na frente de hoje dos slides então então alguns desses fatores são por exemplo a persistência de características abióticas é como mencionei um alto PH por muito tempo uma baixa disponibilidade de água de Carbono uma artificação desse solo de água muito baixo por muito tempo pode
fazer com que se torna um fator de estresse e há também temos um alto nível de competição entre micro-organismos que pode ser um fator de estresse e só corre porque como a gente viu ali naquela naquele gráfico anterior quando a gente tem alto PH alterada só confirmar isso quando a gente tem um PH muito alto a gente tem uma maior proliferação de alguns grupos do do Fio assistindo a bactéria é Santina bactéria elas são conhecidas por produzirem antibióticos e esses antibióticos podem prejudicar outros microorganismos presentes naquela microbiota então como eu coloquei como exemplo alguns microrganismos
do solo podem produzir antibióticos e causar esse desequilíbrio na microbiota do solo E além disso distúrbios frequentes também serão um problema como essas prolongados de seca ou de chuva e também pode ser um problema a distribuição desigual de recursos isso na verdade é um dos principais fatores que afetam a cultivos agrícolas ocorre principalmente por conta do manejo incorreto ao longo do tempo marido incorreto do solo então se você não faz uma adubação periodicamente você pode estar prejudicando o seu do seu cultivo agrícola e para vocês visualizarem melhor como esses fatores de estresse vão funcionar e
como usam fatores que são interdependentes podendo causar um grande Impacto vou falar um pouco para vocês sobre o meu projeto de monografia tá então na minha monografia O meu projeto era baseado em uma doença chamada operador bovina essa periodontite do bovina acomete o gado de uma forma epidêmica então todo o gado praticamente fica doente ao mesmo tempo e não se conhece o motivo a causa dessa doença bom então o que acontece geralmente é que esse gado se alimentando ali do pasto começa a ter os sintomas da periodontite só que como a gente não consegue se
comunicar com eles assim que não percebe e o galo está doente ao longo do tempo essas pequenas lesões que vão se formando na região da gengiva do Gado vão se transformando em abcessos e esses abscessos vão formando uma o inchaço no rosto desse lado é no momento desse inchaço que os pecuaristas conseguem visualizar que o gado não está saudável só que neste momento já é tarde demais a maior parte do Gado já tem os mesmos sintomas e o gado começa a morrer em grandes quantidades digamos assim ó ah ah não se conhecer muito bem o
motivo do porque essa doença acontecia Mais o que foi possível observar em comum entre todas as fazendas onde estava acontecendo é que eram fazendas de plantio recente de partida para capim então eram locais onde recentemente havia ocorrido desmatamento da floresta Nativa para o plantio de pasto para capim então começou a ser estudar um pouco mais sobre esse fenômeno e foi observado que nessas regiões de desmatamento recente ocorre uma maior abundância de bactérias do filo actinobacteria como mencionei esse de bactérias são os especialistas em produzirem antibióticos Então agora vocês Imaginem essa bactéria está ali produzindo antibióticos
perto da região da planta o Galo se alimenta da planta E aparentemente esses antibióticos vão causar um desequilíbrio da microbiota Oral desse gado e isso parece estar envolvido com o desenvolvimento da periodontite explicaria o porquê de todo o gado tem o mesmo sintoma já que a doença aparentemente é proveniente do solo então resumindo essa história o manejo incorreto do solo devido ao desmatamento para o plantio de pasto para capim faz com que ocorra um aumento na competição entre os microrganismos favorecendo abundância relativa de bactérias do filo actinobacteria que produziram antibióticos e isso aparentemente impacta em
uma doença que acomete o gato e que é uma doença muito grave são só para vocês entenderem realmente como todos esses fatores podem estar interligados e causaram um grande problema Oi e a presença destes microorganismos do solo vai ser muito importante para modulação dos ciclos biogeoquímicos Então os processos bioquímicos serão realizados por este micro-organismos daqueles possuem a maquinaria enzimática para isso e são processos que são essenciais para ciclagem de nutrientes e bom então essa estrada de curvadas aqui mostra a transformação de diversas substâncias por este micro-organismos então a transformação de nitrogênio orgânico e nitrogênio inorgânico
de fósforo solúvel em fósforo insolúvel e tudo isso vai ter um impacto posterior tamos pode favorecer a disponibilidade de nutrientes para uma planta por exemplo e isso vai algumas das funções que a gente pode citar aqui é regulação da acidez do solo a regulação da disponibilidade de nitrogênio e fósforo também também de outros nutrientes e micronutrientes Como o ferro enxofre e também Vai facilitar o consumo de carbono orgânico no solo como a gente pode ver aqui eu acredito que você já virou esse mal anterior a transformação de formas lábios de carbono orgânico e uma forma
de carbono orgânico recalcitrante e além desses mecanismos diretos que são realizados pelos microrganismos do solo a gente também tem alguns microrganismos têm alguns mecanismos indiretos Oi e um exemplo que eu trouxe para a gente comentar sobre os mecanismos indiretos EA degradação de xenobióticos do solo então alguns microrganismos são capazes de utilizar substâncias tóxicas presentes no ambiente utilizando como uma fonte de energia e transformar essas substâncias em algo menos tóxico tão o exemplo que o trouxe a degradação de xenobióticos xenobiótico estão por exemplo os agrotóxicos são utilizados na agricultura esses agrotóxicos ao longo do tempo eles
tendem a se acumular no solo se acumulasse a menos nas freáticos E aparentemente algumas bactérias são capazes de utilizar essa substâncias e transformar em algo menos pior então aqui um exemplo né a utilização desse poluente pelo micro-organismo e Através disso transformando em uma substância que não tóxica e pode ser usado por outros micro-organismos desse micro bioma fácil bom então a descontaminação de ambiente é isso é bastante utilizado hoje para quem estuda a partir de biotecnologia Então são estudadas alternativas na qual a gente pode aplicar esses microrganismos ao nosso favor Tá e por isso tão importante
a gente conhecer a diversidade de microrganismos presentes no solo Tá bom então agora eu vou entrar na parte da rizosfera quem quiser dar uma pausa para tomar um café ou alguma coisa a hora essa tá bom bom então é muito tempo atrás se desconfiava que existia um relacionamento especial ali entre as raízes da planta e os microorganismos presentes no solo isso essa suspeita foi levantada Porque nas regiões da raiz da planta já eram observadas formação das estruturas que são os nódulos radiculares né que são formados por esses microrganismos Além disso também era observada formação de
associação na verdade de fungos aqui no caso micorrizas formando também uma estrutura aparentemente especial em 1904 foi observado que os microrganismos da região mais próxima a raiz eram mais abundantes e essa região então mais próxima das raízes foi chamada de risos fera e as rosas espero até hoje E então como uma raiz pode influenciar a microbiota do solo isso acontecer porque os produtos do metabolismo das plantas vão ser liberados pelas raízes e essas substâncias são liberadas são chamadas de estudar se radiculares Então esse cidades radiculares vão possuir função de bióticas e abióticas uma função biológica
que a gente pode citar como exemplo é a interação com outras plantas então esses estudados conseguem avisar uma planta de já senti que essa planta cresceu até esse ponto para outra planta não invadir o espaço dela dela por exemplo ela também consegue se comunicar através a sinalização é quando ela está doente por exemplo e uma função abiótica que a gente pode citar é a influência direta na composição de nutrientes presentes no solo é isso porque esses dados radiculares eles são compostos por nutrientes substâncias que são consideradas nutritivas então nós temos substâncias que são de baixo
peso molecular como aminoácidos açúcares fenóis e ácidos orgânicos e substâncias de Alto peso molecular como proteínas e polissacarídeos e e a composição dos Estudantes articulares vai ser variável para depender das espécies da planta vai depender da idade da planta do tipo de cultivo que essa planta é mantida e é uma importante fonte de carbono para esses microrganismos ali presente bom então aqui um resumo né a planta tá aqui fazendo a fotossíntese dela e o fluxo de carbono passa pela planta saindo pelas raízes dessa planta além das moléculas de alto e baixo peso molecular a gente
também vai ter liberação de uma maior quantidade de água nessa região também de enzima de fatores de crescimento e bom esses estudados tem um papel importante para repelir patógenos e para atrair micro-organismos que sejam benéficos para plantas em alguns desses micro-organismos que ficam ali próximos da raiz da planta conseguem entrar nos tecidos da planta Então os microrganismos endofíticos eles são encontrados nos Espaços intra e inter celular da planta e eles foram evoluíram ao longo da evolução é junto com a planta então que a gente Observe que essa microbiota vai variar dependendo do genótipo da planta
se alguma planta mais novas é uma planta que já tem alguns anos a dependência a planta tá saudável se ela tá doente em qual tecido da planta que ela se encontra se a no interior das raízes o interior das Folhas a depender da prática agrícola que é utilizada no local onde ela é mantida e também que condições abióticas com ph temperatura acho que vocês já entenderam que vai ser muito variadas a microbiota bom então aqui a gente consegue visualizar a região riso esférica onde a gente tem essa parte um pouco mais laranja é a região
riso esférica onde nós vamos ter alguns microrganismos e alguns deles conseguem entrar nos tecidos internos da planta e esses microrganismos endofíticos podem ser obrigatórios facultativos ou passivos os microrganismos obrigatórios eles vão depender da atividade metabólica da planta Então são microrganismos que possuem enzimas específicas para poder entrar nos tecidos da planta ou são microrganismos que já vieram desde a semente junto com a planta como ocorre quando a gente está falando de micro-organismos que coevoluíram junto com a planta existem também os microrganismos endofíticos facultativos Eles são de vida livre então eles estão presentes ali na rizosfera por
exemplo Mas podem colonizar a planta em algum estágio da vida então eles podem possuir esses mecanismos para entrar nos tecidos da planta e os endofíticos passivos que vão ser bactérias que vão acabar entrando na planta então aqui novamente o solo rizosférico aqui a região riso esférica os microrganismos que ficam aqui presentes podem o que acontece a fala de mendofit que obrigatório ou até de um fitopatógenos seria um organismo que vai causar uma doença na planta esses organismos possuem enzimas são capazes de fazer lesões microlesões nas raízes da planta e eles conseguem ativamente antar na raiz
da planta mas às vezes tem um micro-organismo aqui na na superfície da raiz que acaba pegando carona e entrando na região endofítica da planta esse seria o microrganismo do Físico passivo e é eu queria ressaltar aqui como eu citei os micro-organismos que causam doenças nós só chamamos de endofíticos aqueles que não oferecem nenhum tipo de Perigo Para a planta se ele é o microorganismo que causa doença na planta nós chamamos eles de fitopatogênicos ok nós vamos ver um pouquinho mais à frente e e eu queria abrir um adendo aqui para gente falar sobre a filosofia
era e os microrganismos epifíticos vou resumir de novo essa história porque eu realmente quero que fique claro para você de conceitos Aqui nós temos Então os microrganismos de rizosféricos São aqueles que estarão sofrendo influência direta dos estudados da planta alguns deles conseguem entrar nos tecidos internos da planta ou já estão lá presente porque vieram da semente são os microrganismos endofíticos Oi e aí nós temos os microrganismos e psíquicos são aqueles que estão na superfície da planta então se eu pego uma amostra de folha por exemplo leva para o laboratório seu esterilizar a parte de fora
dessa folha Ok estéreo e mas será essa folha eu tô avaliando os microrganismos que estão dentro da folha se eu levar essa folha para o laboratório e escolher estudar só que eles que estão na superfície da folha eu tô falando dos microrganismos epifíticos Tá bom então a região que fica na porção subterrânea da planta é a região da rizosfera e a região que fica na parte superficial e a porção aérea da planta é o que a gente vai chamar de filosfera ok bom então os microrganismos epifíticos também serão influenciados e nesse caso vão ser mais
influenciados pela disponibilidade de nutrientes que vai ser baixa nessa região já que eles estão contra o fluxo da liberação de nutrientes é então nessa região também vai ter uma parte de disponibilidade de água e uma alta incidência de luz então é uma zona fótica também os microrganismos precisam ter a capacidade de sobreviver a todas as condições e e é uma comunidade bacteriana que a considerável de consideravelmente diferente da comunidade presentes nas raízes e tem uma população bastante variável mesmo quando a gente está falando da mesma espécie de planta mesmo se for o mesmo genótipo mesmo
se for o mesmo tipo de cultivo mesmos uma planta estiver do lado da outra então esses microrganismos ainda não são tão estudados nos últimos anos tem ganhado maior relevância E aí para quem tem interesse em trabalhar como produzir do solo esse seria um ótimo tópico por para ser explorado Oi e aí vamos entender mais um pouco Então como que é essa estrutura vai influenciar na diversidade dos microrganismos estão aqui essa parte aqui é marrom acho que amarrou né um pouco mais escura é a parte que é chamada de solo não rizosférico fração que não está
sofrendo influência dos Estudantes articular-se E aí nessa região a gente consegue observar aqui vamos falar que cada bolinha dessa é uma bactéria diferente tá bom tarde tem bolinhas azul e bolinhas pretas bolinhas vermelhas bolinhas verdes e quando a gente se aproxima um pouco mais e vem para essa região aqui que está sofrendo a influência dos estudados portanto é a região riso esférica a gente já observa que a gente tem uma menor diversidade isso porque a gente vai ter um menor número de espécies aqui a gente tinha um dois três quatro cinco aqui a gente só
tem quatro certa bolinhas azuis comigo quando a gente aproxima um pouco mais da raiz da planta o que a gente vê que essa diversidade reduz mais ainda é o que que seria um pouco mais aqui eu tô falando do rizoplano que é a superfície da raiz da planta Então quando você pega uma planta se você der uma chacoalhada nela Ela vai soltar um solo que pode ser considerado o solo rizosférico e uma porção de si só vai continuar aderido à raiz da planta que Ele sobra também e a solo rizosférico e tá associado ao rizoplano
que a superfície dessa raiz da planta bom então esses microorganismos associados ao vivo o plano é a gente veio aqui que a gente tem uma diversidade minha nora ainda já que essas bolinhas roxas aqui sumiram e quando a gente fala da região indo fica no interior dos tecidos a planta a gente tem uma diversidade menor ainda ou seja a gente vai ter uma redução da diversidade de espécies quando a gente compara o solo não rizosférico com a região em do fica Tá bom então vai ser uma redução gradual de um ponto até o interior da
planta e para mostrar para vocês eu vou falar de novo sobre o meu projeto só que agora o meu projeto da de sensação Então nesse projeto eu decidi estudar essa planta muito bonita aqui chamada capuchinha ela é uma punk uma planta alimentícia não condicionar não não convencional aqui no Brasil mas lá fora ela é considerada uma planta medicinal ela tem uma crescente relevância nos últimos anos porque ela tem sido bastante utilizada na agricultura orgânica e também na gastronomia porque as folhas as folhas e as flores elas são comestiveis e ela é muito bonita também então
é usado em projetos de paisagismo enfim e ainda não tinha nenhum estudo de Ecologia microbiana voltado para essa planta então na minha na minha prestação eu estudei essa planta fiz um estudo da comunidade bacteriana associada essa planta e fiz um sequenciamento das raízes dessa planta então eu fiz você com e do solo não rizosférico que você já sabe o que é fiz você conhecimento da rizosfera e fiz um sequenciamento da região endofítica dessa planta tá bom e nesse caso eu queria acessar todas as bactérias que eu conseguisse que está sem que estivessem presentes nessas regiões
tá então eu fiz um sequenciamento e que você Pensamento a gente recebe muitas sequências faz todo processamento é acredito que vocês vão ter uma aula específica sobre técnicas para estudar ou não provê uma dessas plantas e aqui eu fiz uma análise que a gente é análise tchau tá o nome dela e essa análise mostra para a gente é Monalisa diversidade e mostra pra gente o número de espécies principalmente são Aqui Nesse quesito estamos avaliando o número de espécie eu tinha 5 réplica está bom cinco pontos de cada lugar de cada local são essas bolinhas pretas
aqui diferente que vocês observam Oi e o quê que eu visualizei no solo não nos esférico eu tinha um maior número de espécies ou seja uma maior riqueza quando comparada com a região riso esférica e da região riso esférica para a região e do física eu consigo também observar que houve uma redução dessa riqueza de espécies e por quê que isso acontece né É comum que a gente pensa que como na região dos esférica eu tenho uma maior liberação de nutrientes eu vou favorecer a proliferação de bactérias Mas e você vai mesmo só que essa
maior disponibilidade de nutrientes em maior tipo maior proliferação bacteriana ou fúngica né vai fazer com que ocorra um aumento da competição entre estes micro-organismos então não são todos os microrganismos que vão se dar bem na região visão esférica isso vai inclusive suprimir alguns grupos de microrganismos é por isso que a gente consegue observar uma maior riqueza um sorriso esférico quando comparado com a região e do física e com a região dos esféricos bom então é a gente consegue concluir desse dado aqui que quanto mais íntima é a relação entre os microrganismos e as plantas mas
esses microorganismos vão precisar possuir características específicas para sobreviverem nesse local ou seja não é para todo mundo é fruto proveniente de viverem na região do física por exemplo eles precisam possuir enzimas certo para poder entrar nos tecidos da planta o preciso ter sorte de pegar uma carona mas lá dentro eles também vão precisar possuir mecanismos para sobreviver em diferentes dos micro-organismos que estão no solo eles precisam de outros mecanismos por isso a gente vê essa mudança de um ponto para outro é uma Outro ponto que foi avaliado foi abundância de fios dessas regiões tá eu
trouxe aqui uma pequena informação só para ti tudo de comparação mesmo que na região e do Fit que Jesus fere que a gente observou dominância de três fios tá então fico proteobactérias que não bactérias firmicutes e no solo foi observada a dominância dos fios proteobactéria actinobactéria e ácido bactéria tão filo proteobactéria dominou aqui nas três regiões certo esse filo ele se não é o maior é um dos maiores fios que existem e vão ter bactérias de vida livre em bactérias fitopatogênicas tem bactérias de promotores de tem bastante uma favorecer o crescimento da planta então é
um filo muito diverso e faz sentido é coerente que ele seja mais abundante aqui o filo actinobacteria apesar de ser dominante nessas três regiões foram avaliadas ele é mais abundante nos e quando comparado com essas duas regiões o fio ácido bactéria também aparece aqui não aparece nas demais esses dois fios aqui actinobactéria sido bactéria eles possuem táxis possuem gêneros e espécies de micro-organismos que são ubiquamente presentes no solo estão fortemente Associados a ciclagem de nutrientes aos ciclos biogeoquímicos por isso é coerente encontrar uma maior abundância desse gênero desses fios desculpa na região do solo e
na região endofix do espere que a gente encontra também é que time bactérias essas bactérias também podem ser favoráveis para planta podem ser benéficas para planta e a gente também vê uma dominância do filo firmicutes esse fio firmicute também possuem bactérias são benéficas para planta Então isso é só para vocês entenderem como vai ser essa diferença e como esses dados são coerentes é porque a gente já tem na literatura vários outros estudos que já foram feitos com a microbiota de outras plantas só a gente consegue comparado a nossa planta com o que já existe e
chegar à conclusão se isso é um dado que é coerente ou não E qual seria aplicabilidade desses microrganismos em cada um dos locais onde eles estão bom então a interação entre os microrganismos EA planta ela pode ser benéfica e essa relação benéfica pode trazer também benefícios quando a gente pensa e uma aplicação biotecnológica para Indústria Farmacêutica ou então para agricultura ou essa interação entre microrganismo em planta pode trazer problemas para a planta como por exemplo doenças Ah então vou falar rapidamente sobre esses benefícios porque vocês vão ter uma aula voltada só para isso mas é
as bactérias que estão associadas a planta que são capazes de conferir benefícios para essa planta nós chamamos elas de bactérias promotoras de crescimento de plantas tá então nós podemos chamar essas bactérias de bactérias promotoras de crescimento de plantas aqui lembrou em bactéria Ou a gente pode chamar de endofíticos promotores de crescimento de plantas aqui tá escrito errado é PG e tá ou então existem fungos também são promotores de crescimento de plantas Tais seria pgp.inf algumas pessoas também chamam de PG PR estaria falando de bactérias dos Feras bom então tudo vai depender de como é o
seu estudo e como você gostaria de caracterizar as bactérias que você escolheu tá essa parte de fungos e promotores de crescimento de plantas também não é muito estudado na literatura até hoje então aí ó segunda dica para quem tiver vontade de trabalhar com microbiologia agrícola é essa é uma boa opção aí então essas eu vou chamar de perder o bebê tá bom porque a partiu que o trabalho efetivamente bom então essas pedir PB elas vão promover o crescimento de plantas através de três principais frentes E aí a gente pode citar a fitoestimulação aqui pode ser
induzindo a planta a produzir hormônios que sejam benéficos para o crescimento dela ou então produzindo esses hormônios que são benéficos para o crescimento da planta a Expedia PV também podem agir na frente da biofertilização a que seria favorecendo a disponibilidade de nutrientes para essas plantas e também podem agir na frente de controle biológico a que seria possuindo a atividade contra fitopatógenos ou induzindo genes de resistência na planta ser uma aula específica Então tudo isso vai ficar mais claro para vocês é Qual é a soma sim detalhe essas pedir PB elas são de grande interesse atualmente
porque elas têm uma grande aplicação biotecnológica porque Parando para pensar sobre o assunto se ela se promovem o crescimento de plantas se eu consigo favorecer o crescimento da planta através da biofertilização eu posso substituir um agrotóxico por essa pedir a cabeça isso é muito utilizado biotecnologicamente falando a gente busca cada vez mais alternativas que possam reduzir a utilização desses agrotóxicos EA utilização de pedir PB seria uma forma sustentável de utilização dessas substâncias é mas também interação entre microrganismos em planta pode ser benéfica e a gente vê muitas fita ou patologias que afetam principalmente a agricultura
são alguns exemplos aqui é a necrose aqui tá vendo na folha dessa planta isso daqui interfere diretamente na fotossíntese dessa planta e pode levar à morte aqui a formação desses Anéis também foliares amarelados essas doenças podem ser fúngicas bacterianas virais aqui a gente consegue observar também uma podridão mole na base da planta vários vários microorganismos podem causar essa podridão mole é o que acontece geralmente é um microrganismo que conseguiu entrar na região interior da planta na região a dor física da planta mais começa a causar uma doença nessa região é causando uma necrose que vai
fazer com que essa planta tombe e geralmente quando acontece isso não é é uma planta que está doente mas várias outras então causa grandes perdas econômicas Acho que tô patologias hoje causam muitas crises econômicas mesmo e são necessários métodos de controle dessas doenças já que mesmo utilizando os agrotóxicos eles não tem uma atividade específica contra esses fitopatógenos e oi oi Por fim porque estudar esses microrganismos então nessa se adução solo e as plantas Eu acho que eu dei vários exemplos de potenciais aplicações biotecnológicas deles é eu fiz isso provavelmente para suspeita mesmo como eu sou
mais voltada para a parte do tecnológica eu já trabalho pensando no que isso poderia ser utilizado então eu trouxe aqui como exemplo 1 mil inoculante do inoculante é um produto à base de microrganismos e quando eles são aplicados ao cultivo agrícola eles conseguem promover o crescimento da planta ou então conseguem favorecer a ação da planta contra fitopatógenos então isso aqui é um composto de envolvido com microrganismos na sua base bom e isso é muito importante principalmente para agricultura orgânica que como eles não têm agrotóxicos eles têm muito de problemas com pragas certo não só pragas
como também fica patologias e a utilização desses compostos pode ser muito favorável além de também como Eu mencionei favorecendo em pelo menos uma redução da utilização de agrotóxicos né Gente vocês devem saber a os grandes impactos que esses agrotóxicos podem causar não só no meio ambiente mas também para nossa saúde então é muito urgente que a gente explore alternativas para reduzir pelo menos a utilização deste produto que são tóxicos é um outro exemplo que eu trouxe aqui é a utilização de rhamnolipids E surfactinas essas substâncias aulas podem ser isoladas de microrganismos EA que mostra que
são substâncias que possuem atividade antibiofilm e antimicrobiana tão isso daqui por exemplo possui um potencial para ser utilizado na indústria quando a gente pensa em uma produção em larga escala de cerveja por exemplo essas indústrias possuem grandes biorreatores e tem muitos problemas com formação de biofilme Então essas substâncias poderiam ser utilizadas para controlar a formação desses biofilmes locais não só nesse exemplo que eu dei mas também para outros tipos de superfícies e é isso são substâncias isoladas de microrganismos então não só polissacarídeos podem ser isolados desses microrganismos mas também enzimas antimicrobianos e antibióticos também são
isolados deste microrganismos e a gente só Descobre isso com a pesquisa de base que é estudando a Ecologia desses microrganismos onde eles estão presentes o que eles são capazes de fazer por isso é tão importante a gente conhecer a microbiota associada a esses lugares tá bom gente ó eu queria te agradecer a atenção de vocês se você tiver em qualquer dúvida críticas ou sugestões vocês podem entrar em contato comigo por esse e-mail tá bom e muito obrigada pela presença virtual de todos e até a próxima galera
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