Testes de desvios de Hardy-Weinberg

oi oi eu sou de algo meio da universidade de são paulo e esse é um vídeo em que eu vou trocar de teste de rádio um albergue a gente já viu a teoria do modelo de rádio albergue e o que eu quero tratar hoje nesse vídeo é como diante de uma amostra de uma população que a gente tenha dado genéticos a gente pode se perguntar se as frequências genotípicas e as lésbicas têm caixão nos esperadas de acordo com o meu modelo de rádio américa aqui um exemplo com dados reais de um grupo sanguíneo chamado mn

para uma população europeia em indivíduos foram estudados e esses mil indivíduos foram classificados de acordo com o seu genótipo nesse longos 298 deles eram musical cm m489 eram heterozigotos mn e 213 eram homens zigotos nn a pergunta que eu proponho para vocês aqui eu vou resolver é essa é uma população que se encaixam nos pressupostos de rádio o albergue como que a gente e essa questão basicamente a gente vai olhar o número observado dos genótipos e a gente vai comparar ele com o número esperado se a população de fato seguinte aquele modelo como que eu

faço para calcular o número esperado de genótipo sobre uma modelo de região e segue vamos primeiro passo primeiro passo é a partir dessas frequências absolutas genotípica do esses números genotípicos e calcular a frequência de cada um dos genótipos aqui nesse caso é muito simples porque como o número total em mil a frequência do genótipo e missão e visão é 0,290 e oito a frequência do genótipo heterozigoto a 0,4 89 e a frequência do genótipo nn é [Música] 0,88 13 a gente também pode calcular para essa minha amostra populacional as frequências américas a gente sabe que

a frequência do alelo m equivale a 0,2 98 mas metade da frequência dos atores e outros 0,48 roda / 2 e esse valor aqui que vale a 0,5 425 e você podem fazer a mesma conta para a frequência do alelo n e vocês vão chegar em 0,45 75 e evidentemente você nem precisaria fazer essa conta porque como eu tô com um bloco tem dois alelos a frequência do alelo n vai ser um menos a frequência do outro lado bom tenho essa informação agora dessa geração aqui eu sei as suas frequências genotípicas e as frequências alélicas

agora o que eu tô interessado em saber essa mesma população que tem alelos m n frequências conhecidas quais seriam as frequências genotípicas inspirada se ela de fato seguisse o modelo de rádio inverno então para chegar nesse aqui eu vou escrever aqui embaixo é o número é inspirado eu vou escrever só o número esperado mas você tem que subir entender que eu estou complicando aqui é o número esperado de cada genótipo sobre o modelo de rádio airbag como eu faço essa conta gente quantos genótipos do tipo em missão e visão eu espero uma população em que

atende aos pressupostos de ser muito grande cruzamento se dão ao acaso número de machos e fêmeas época aproximadamente igual elas têm frequências genotípicas parecidos e não ocorre a seleção migração e nenhum outro processo aqui altera a frequência alérgicas ao longo do tempo eu sei para essas condições privê quantos genótipos homozigotos e mesão eles não deveriam estar presentes a frequência do genótipo homozigoto enem é simplesmente a frequência do alelo m ao quadrado a proporção de heterozigotos que o esperam é duas vezes a frequência de ml precisa frequência dna e a frequência de genótipos homozigotos n essa

frequência n ao quadrado que isso daqui me dá as proporções que eu espero quando o meu modelo de rádio o alex está em vigor e cada uma das classes de notícias mas eu tô interessado aqui em observar entrou por um número esperado de genótipos é para não a proporção mas o número eu tenho que multiplicar cada uma dessas profissões pelo número total de indivíduos que têm uma população número total é nenhum eu vou chamar esse número total de n maiúsculo aqui não confunda sn com esse daqui aqui ele é o alelo do grupo sanguíneo esse

daqui é o número que refere-se ao tamanho total da população então se eu multiplico essa proporção por mil e essa proporção por nenhum oi e essa aqui também eu chego ao número esperado de genótipos de cada uma dessas classes mmn quando o modelo de rádio onde está vigorando eu vou deixar você fazer essas contas pois eu vou colocar os valores aqui que eu cheguei aplicando esses valores aqui eu tenho 294 vírgula 3 aqui eu tenho 400 e 96,4 e aqui eu tenho 209,3 super importante entender o significado desses números esses são os números de genótipos

de cada tipo que eu espero encontrar numa população que tem as frequências alélicas estão aqui quando a regra conjunto de pressupostos e rádio uma adega estão entre boa e é a última etapa então que falta para gente e a gente comparar esses valores observados o esses valores esperados bom no olhômetro 298 e 294 vírgula 3 489 em relação 496 e 213 em relação 209 parecem próxima e talvez essa diferença que existe aqui eu já simplesmente o fato de que eu não tô estudando população inteira eu tenho só uma amostra de indivíduos e tem algum erro

amostral então eu teria as inclinação a dizer que essa mostra que vem de uma população que atende aos pressupostos rádio uma berg mas é preciso ir além eu preciso de alguma forma testar mais formalmente essas diferenças e tentar examinar se tem alguma base estatística para dizer que esses números observados são diferentes ou não nos valores esperados em suas várias formas de implementar testes estatísticos eu vou apresentar para vocês uma delas que é classicamente utilizada e não é necessariamente a melhor em todos os contextos mas ela serve para a gente entender a lógica de testes estatísticos

aplicados para esse tipo de questão é um teste do famoso que quadrado eu quero ver tem esse símbolo aqui para simbolizar a estatística que vai ser consultada e ela é calculada comparando os números observados e esperados de cada uma das costas de notifica cê essa diferença é elevada ao quadrado e a normalizado pelo número esperado e eu vou por aqui uma somatória aqui na frente e essa somatória vai de igual até cá onde cá se refere ao número de classes que estão sendo comparadas você pode parecer complicado mas é muito simples banda também que observado

esse número ou esperava é esse essa diferença ao quadrado dividido pelo valor esperado eu faço isso para cada um dos três genótipos isso me dá o valor de qui-quadrado para esse conjunto de dados que eu tô observando fazendo isso e eu chego esse número de 0 22 porque uma medida e de alguma forma conte fica a discrepância entre os valores observados e esperados passa o seguinte é tentar entreter interpretar esse valor aqui de qui-quadrado para fazer isso eu vou consultar uma tabela a tabela associada a distribuição de qui-quadrado que vai me dizer qual que é

a probabilidade eu tenho um desvio dessa magnitude entre dados observados e esperados simplesmente ao acaso e para fazer isso eu preciso também carregar uma informaçãozinha adicional se refere o número de graus de liberdade associada ao nosso teste número de graus de liberdade ele tem uma relação com o número de classes que estão sendo comparado entre observado esperado ea quantidade de informação que eu extrai ataque dos dados quantas classes que eu tô comparando são três genótipos mas na verdade esses trem de nilópolis são apenas dois genótipos independentes e quando você dois genótipos o terceiro é previsível

porque o oi total então são duas classes independentes além disso eu usei informação a partir desse genótipos para calcular os valores esperados porque eu ensinei frequências alélicas eu tenho uma frequência alélica independente porque acordou sem uma os e a outra então o número de graus de liberdade equivale ao número de classes sendo comparada menos a quantidade de informação que o strass os meus dados eram duas classes independentes eu calculei uma frequência alélica dela e significa que eu vou usar o teste de qui-quadrado com um grau de liberdade nesse caso para um grau de liberdade essa

magnitude de desvio entre os valores observados e esperados de 0 22 a tabela vai indicar o p-valor de 0,63 isso equivale a probabilidade de ao acaso eu encontrar um desvio desse valor o maior até uma probabilidade muito alta e significa que eu não tenho nenhuma razão para desconfiar que essa miguel população com os números outros e não se encaixa no modelo de rádio albergue por que um dos vizinhos tão pequeno é muito frequentemente esperado de acordo com o meu teste de rádio mayberg isso até um valor muito comum para populações humanas no sentido de que

a maior parte dos genes que a gente tudo em populações humanas ele segue surpreendentemente bem os valores esperados pelo modelo de rádio mangue a gente acabou de ver que o que quadrado pode ser utilizado para comparar as frequências genotípicas observadas e esperadas e através um teste estatístico a gente pode testar a hipótese de que a nossa mostra veio de uma população que está ou não em equilíbrio de rádio airbag eu vou mostrar pra vocês uma outra maneira da gente comparar as frequências genotípicas observadas e esperadas que tem uma simplificação e tem bastante apelo ideológico isso

envolve você olhar especificamente na classe de heterozigotos observado esperado é a ideia que existe uma série de processos biológicos que podem mudar a quantidade de a trouxe go to que estão na população um deles vocês já conhecem das aulas de genética quando mendel tava fazendo linhagens puras de ervilha ele alto tá com dava ela processo de autofecundação faz com que você produza a cada geração uma proporção maior de homozigose ea cada geração - heterozigotos por que porque quando você alto fecunda o indivíduo homozigoto todos os descendentes não somos igoto agora quando você alto fecunda um

indivíduo que é heterozigoto você vai produzir genótipos na proporção de um para dois para um só metade dos descendentes de autofecundação de certo rigotto ou também certo o zigoto repetindo esse processo por sucessivas gerações aumentam-se as proporções de homozigotos e você vai diminuindo a quantidade de heterozigotos presentes da população então autofecundação sucessiva ela tem esse efeito de o passar das gerações e essencialmente eliminando os atores esgoto a população e não outra direção um processo que pode aumentar a frequência de heterozigotos na população essa seleção natural existem alguns genes que são estudados pelo grupo aqui na

universidade de são paulo ligados ao funcionamento do sistema imune a onde indivíduos que são heterozigotos tem uma chance de sobrevivência maior do que os indivíduos que são homozigotos e subir órgãos pressuposto de um remédio mas tem como consequência uma proporção maior de atores go tem observado na população do que seria esperado pelo modelo de rádio mede tudo isso para dizer que é interessante eu fazer uma comparação entre número observado o esperado de rádio web e um jeito de eu fazer isso é através de uma estatística tá com um f de novo mas esse f agora

não é mais uma frequência ele é um coeficiente é lindo camilo e ele é uma métrica que é feita justamente para comparar a taxa de atores e goze esperada com a caixa de atores igual a ser observado eu vou definir esses termos aqui e ela normalizada pela taxa de atrás de gosma esperar bom que que é a taxa de a todos iguais esperada é proporção de heterozigotos que eu espero encontrar na minha população sobre o modelo de rádio mayberg aqui isso aqui é o número total de átomos de gostou espero como o número total dessa

população é nyu é fácil calcular a frequência dessas gotas consideraria 0,496 há 496 14 que no fim bom qual que é a proporção de heterozigotos que é observada na minha população 489 sobre mil a 0,4 89 eu posso então aplicar essa expressão zinho aqui e eu vou chegar num valorzinho' ds aqui nesse caso 0,01 e esse favor bem pequenininho ele reflete algo que a gente já viu nos dados a proporção de heterozigotos observada é esperada é bastante similar consequentemente esses valores são similares isso aqui reflete a proporcionalmente a diferença entre a quantidade de heterozigoto e

homozigoto observados nessa população o coeficiente de endogamia então ele vai assumir o valor positivo ou negativo dependendo dessa desproporção entre a todos os grupos esperados e observados em situações onde ocorre bastante endogamia eu tenho uma escassez de a todos os gostos a população esse valor de f pode ser positivo e pode assumir valores muito alto como o exemplo que eu dei anteriormente no caso de endogamia de sentido o f ele é uma métrica super útil para a gente entender processos que estão ocorrendo na população uefi também o otávio para calcular o quadrado de uma maneira

um pouco mais simples do que essa que eu apresentei antes para vocês e o que quadrado pode ser também definido como o produto do tamanho da população está sendo estudada x f ao quadrado isso e essa expressão mais complicadas são equivalentes então se você representa um atalho na hora que você fazer a sua estimativa do grau de desvio dos observados e esperados aquela amostra populacional para concluir esse vídeo eu quero que vocês têm mente de qual a importância de fazer esse tipo de teste eu acho que o recado o principal é que as populações naturais

são muito complexas e elas estão sujeitas a uma série de processos incluindo seleção natural e deriva genética migração e mutação relativamente difícil a gente entender quais processos estão correndo na população a distância a população está em rádio airbag a porta de entrada para esse processo de investigação uma população que não está em rádio mayberg por exemplo porque ela tem mais heterozigotos o que o estado para o meu modelo ela apresenta um desvio que suscita investigações adicionais por outro lado uma população então não rejeito o rádio um albergue ou seja ela é consistente de acordo com

o teste estatístico para rádio albergue e isso não quer dizer que aquele processo não estejam ocorrendo processo como seleção migração mutação e deriva significa apenas que se eles estão correndo eles estão correndo uma intensidade que não é suficiente para perturbar a população e resultaram desvio significativo nesse sentido o rádio web um teste útil porém limitado e ele é muito útil porque quando você observa um desvio significativo das expectativas de rádio albergue e o significa que algum processo interessante está ocorrendo e merecem investigação mais detalhada porém ausência de desvio de rádio um albergue não é sinônimo

de ausência e se processa apenas ausência de um efeito significativo que a gente corre consiga detectar os dados que a gente disponha e com isso encerro esse tratamento de rádio em berg e vou sugerir que vocês podem exemplos na literatura ea vários deles que ilustram a aplicação desse modelo em situações concretas que pesquisa biológica